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细胞调控基因hCHK2多态性与食管癌易感性的研究
 

细胞调控基因hCHK2多态性与食管癌易感性的研究

2011-08-24 访问量:182
作者:张慧霞 陈艳 尹东, 邓彦超, 马彦清, 居来提 作者单位:新疆医科大学1公共卫生学院, 2附属肿瘤医院, 3第一附属医院, 新疆乌鲁木齐830011

  【关键词】 细胞调控基因 hCHK2多态性 食管癌易感性

  susceptibility of esophageal cancer ZHANG Huixia, CHEN Yan, YIN Dong, et al

  (School of Public Health, Xinjiang Medical University, Urumqi 830011, China)Abstract: Objective: To determine the association between hCHK2 polymorphism and the susceptibility of esophageal cancer in Han nationality. Methods: A casecontrol study was conducted. The polymorphism between hCHK2 gene at rs2278022、rs2602431 and rs2970077 position was analyzed by polymerase chain reactionligase detection reaction (PCRLDR) methods in 107 esophageal cancer cases and 204 noncancer controls. The frequencies of genotype and allele and the association between the genetic polymorphisms and cancer risk were analyzed. Results: No significant difference was observed in the frequency of hCHK2 gene at rs2278022、rs2602431 and rs2970077 position genotypes between cases and controls (P>0.05). Conclusion: The polymorphism of hCHK2 gene at rs2278022、rs2602431 and rs2970077 position is unlikely to be associated with the susceptibility of esophageal cancer.

  Key words: hCHK2; esophageal cancer; susceptibility; genetic polymorphism随着对细胞周期及其调控的深入认识,学者们提出了“癌症可能是一类细胞周期异常性疾病”的观点[1]。绝大多数肿瘤细胞都存在若干细胞周期调控机制的改变,周期调控机制的异常可导致细胞的持续性增殖,是肿瘤发生的生物学基础。CHK2是近来新发现的一个细胞周期调控蛋白。在发生DNA损伤或复制阻滞后,细胞通过不同途径激活CHK2,进而作用于下游不同的靶蛋白,最终激活G1、S和(或)G2/M期检测点机制,使细胞周期进程发生阻滞,同时激活修复相关基因的转录,促进细胞对损伤进行修复。由于CHK2在细胞周期中具有重要的负调控作用,许多学者认为CHK2起着抑癌基因的作用,它的异常会导致细胞周期检测点对DNA损伤或复制阻滞不能发挥正常功能,从而引起肿瘤易感性增加,最终导致肿瘤的发生或发展。因此,我们采用聚合酶链式反应连接酶检测反应(polymerase chain reactionligase detection reaction,PCRLDR)技术对新疆汉族人群107例食管癌患者和204例非食管癌患者进行了hCHK2 rs2278022、rs2602431和rs2970077基因多态性的检测,并分析探讨了其基因多态性与食管癌遗传易感性之间的关系,以期为食管癌的防治提供理论依据。

  1材料与方法

  1.1研究对象收集2005~2007年间新发的、由5所医院(新疆医科大学第一附属医院、第二附属医院、附属肿瘤医院、伊犁州新华医院、伊犁州友谊医院)经内窥镜、X线及病理确诊的汉族原发性食管癌患者107例作为病例组,其中男性76例,女性31例,并选择与病例无血缘关系、同民族、同性别、年龄相差±5岁、同期住院的非食管癌患者204例作为对照组,其中男性151例,女性53例。所有研究对象采集外周静脉血4 ml,EDTA抗凝,20℃保存至提取DNA。全部调查对象均知情同意。

  1.2方法

  1.2.1DNA的提取 改良Miller盐析法[2]提取的DNA溶于TE缓冲液中,-20℃保存备用。

  1.2.2聚合酶链式反应连接酶检测反应(PCRLDR)分析采用Primer 3.0软件设计特异性引物,见表1。表1hCHK2基因3个SNP位点的上、下游引物序列hCHK2基因SNP位点上游引物(5′3′)下游引物(5′3′)产物长度

  PCR反应体系:总体积20 μl,含模板DNA 1 μl,1×Buffer缓冲液2 μl,Mg2+0.6 μl,dNTP 2 μl,Taq DNA聚合酶0.3 μl,1×QSolution 4 μl,Primer引物0.4 μl,浓度0.2 pM,加水补足。反应条件:95℃预变性15 min;94℃30 s,57℃退火1 min,72℃延伸7 min,35个循环。根据LDR探针设计原则[3]设计LDR的荧光探针,对该基因待检测的SNP位点,在位点的5’方向根据SNP的碱基类型设计两条特异性探针,每条探针的3’末端碱基分别与此位点的一种等位基因型相对应,此外在该位点的3’方向序列中设计一条末端带有FAM修饰的通用探针(蓝色荧光),见表2。表2hCHK2基因3个SNP位点LDR连接反应探针序列探针名称探针序列(5′3′)产物长度反应条件:95℃2 min,94℃30 s,60℃2 min,进行35个循环。

  1.2.3基因分型取LDR产物、内参比荧光ROX和测序胶上样缓冲液(loading buffer)各1 μl等体积混合,应用377型DNA测序仪(ABI,美国)检测结果。以ROX为内参分子量标准,检测不同长度DNA片段的荧光强度,并根据产物片断大小确定基因型。

  1.3统计学处理全部统计分析在SPSS15.0软件上进行。HardyWeinberg吻合度检验及两组间基因多态性位点的基因型和基因频率比较采用χ2检验,检验水准α=0.05。

  2结果

  2.1PCR实验结果PCR反应产物用3%的琼脂糖凝胶电泳检测,结果见图1。

  2.2hCHK2 rs2278022、rs2602431和rs2970077位点基因分型结果应用ABI公司Model自动测序仪进行序列分析,确定hCHK2 rs2278022、rs2602431和rs2970077位点基因型,结果见图2。

  2.3遗传平衡检验经HardyWeinberg遗传平衡检验得出hCHK2基因rs2602431、rs2278022、rs2970077位点所对应的P值均>0.05,符合HardyWeinberg遗传平衡定律[4],表明研究对象的选择无遗传学偏差,该群体是遗传平衡群体,具有一定的人群代表性。

  2.4hCHK2 rs2278022、rs2602431和rs2970077 3个位点等位基因和基因型与食管癌易感性的关系hCHK2 rs2278022、rs2602431和rs2970077 3个SNP位点基因型在病例组和对照组中的频率分布经χ2检验后,不同位点基因型频率分布差异无统计学意义(P>0.05),结果见表3。

  3讨论

  食管癌(Esophageal Cancer,EC)是全世界最常见的十大恶性肿瘤之一,全世界每年新发病例可达48万人[5],是发展中国家最常见的一种消化道恶性肿瘤,是危害我国居民健康的主要恶性肿瘤之一[6]。食管癌的发生和发展是一个多因素、多阶段的综合过程,其发病机制目前尚未明确。由于DNA损伤是细胞癌变的前提,为确保DNA损伤后遗传物质的完整性和正确性,机体细胞的DNA修复系统和细胞周期调控系统发挥了重大作用,因此对细胞调控基因hCHK2(细胞周期检测点激酶2)基因的多态性进行了检测。细胞周期检测点激酶2 (checkpoint kinase 2, CHK2)基因位于染色体22q12.1,包含14个外显子,其cDNA全长为1 731 bp。细胞周期检测点在细胞周期调控中起重要作用,可以检测细胞外界或内部的各种异常,从而抑制细胞周期的进程,同时修复损伤或使不能修复的细胞进入凋亡。检测点作为保护机制可确保遗传的稳定性。一旦检测点发生缺陷,带有损伤的细胞可能会异常扩增,使肿瘤发生的风险大大增加。对于hCHK2基因,Zheng等[7]的研究表明,第84密码子A252G多态性与患头颈部鳞状细胞癌的风险性也有关;Jonine等[8]的研究表明,CHEK2*1100delC与乳腺癌的遗传易感性有关,可增加患乳腺癌的风险。但其多态性与食管癌易感性的关系未见报道。本研究通过http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP、http://www.hapmap.org等人类基因组和单体型数据库,根据SNPs的入选标准,即所选择SNPs的杂合度在中国人群中应>5%,挑选了hCHK2 rs2278022、rs2602431和rs2970077 3个SNP位点进行其多态性与食管癌易感性关系的研究。本次研究结果显示,hCHK2 rs2278022、rs2602431和rs2970077 3个SNP位点基因型频率在病例组和对照组中的分布无显著性差异,未发现hCHK2 rs2278022、rs2602431和rs2970077多态性与食管癌的发生有关,单一基因的作用可能是微弱的,要想进一步探明其相互间的关系,尚需扩大样本数,以便作更深入的研究。

  【参考文献】

  [1]韦伟, 龚建平, 裘法祖. 细胞周期调控与肿瘤的发生发展[J]. 癌症, 1999, 8:9597.

  [2]Miller SA, Dykes DD, Polesky HF. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells[J]. Nucleic Acids Res, 1988,16:1215.

  [3]Luo J, Bergstrom DE, Barany F, et al. Improving the fidelity of thermos thermophilus DNA ligase [J]. Nucleic Acids Res, 1996, 24(14):30713078.

  [4]陈竺.医学遗传学[M].北京:人民卫生出版社,2005:121128.

  [5]卫生部卫生统计信息中心, 全国肿瘤防治研究办公室.中国恶性肿瘤危险因素研究[M]. 北京: 中国协和医科大学出版社, 2003:20.

  [6]李连弟,鲁凤珠,牧人,等.中国恶性肿瘤死亡率20年变化趋势和近期预测分析[J].中华肿瘤杂志,1997,19(1):310.

  [7]Zheng YX, Li L, Shen HB, et al. Polymorphic hCHK2/hCds1 codon 84 allele and risk of squamous cell carcinoma of the head and neck a casecontrol analysis[J]. Carcinogenesis, 2001, 22(12):20052008.

  [8]Jonine L, Bernstein L, Sharon N, et al. The CHEK2*1100delC allelic variant and risk of breast cancer: screening results from the breast cancer family registry[J]. Cancer Res, 2006, 15:348352.

 
 

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